本院成立於民國四十一年元旦，原為陸海空軍肺病療養院，民國四十四年改為陸軍第一肺病療養院。至民國四十八年七月，因社會環境的需要，乃由軍方正式改隸行政院國軍退除役官兵輔導委員會，並命名為嘉義榮民醫院，下設仙草、灣橋、鹿滿、田中四個分院。民國五十二年隨階段性任務陸續完成，仙草及田中分院相繼轉型為白河榮家及彰化榮家，民國五十五年灣橋分院亦隨之獨立為灣橋榮民醫院，並下轄鹿滿分院。本院復於民國六十三年三月由肺結核病院改為綜合性醫院，並附設民眾診療所，民國七十三年經行政院衛生署納入全國醫療網，以原有設施更新擴建，由榮總提供醫療技術支援，自民國七十九年至九十三年相繼完成醫療網第一至四期擴建工程，除為榮民提供妥善之醫療服務，同時並兼辦民眾醫療服務。